Schrijf je vandaag nog in voor de Virtual Cell Challenge en gebruik AI om een van de meest complexe problemen van de biologie op te lossen. De wedstrijd, die in @CellCellPress werd aangekondigd, wordt georganiseerd door Arc Institute en gesponsord door @nvidia, @10xGenomics en @UltimaGenomics.

Cel papier: Website: Deelnemers zullen modellen maken die de effecten van verstoringen van één gen in cellen zullen voorspellen. De topteams ontvangen prijzen ter waarde van $ 100k, $ 50k en $ 25k - gelijke delen contant geld en @nvidia DGX Cloud-credits.

Voor de inaugurele uitdaging heeft Arc een nieuwe single-cell transcriptomics-dataset gegenereerd van 300.000 H1 menselijke embryonale stamcellen met 300 genetische verstoringen, die tijdens de hele competitie in segmenten zullen worden ingezet voor finetuning, validatie en testen.

De uitdaging zal specifiek evalueren hoe goed modellen veranderingen in genactiviteit kunnen voorspellen wanneer individuele genen tot zwijgen worden gebracht. De tussentijdse prestaties van de deelnemers worden gedeeld op een live leaderboard, vóór de definitieve beoordeling en bekendmaking van de winnaars in december.

"Het vermogen van modellen om te generaliseren naar nieuwe celcontexten is uiteindelijk de sleutel tot het ontsluiten van virtuele cellen voor het ontdekken van geneesmiddelen en we hopen dat deze uitdaging uiteindelijk zal helpen om de vooruitgang naar dat doel te versnellen", zegt Arc CTO @davey_burke.

We zijn de sponsors van de Virtual Cell Challenge (), leiders op het gebied van AI, eencellige en ruimtelijke biologie en DNA-sequencing die zich bij Arc hebben aangesloten om de grenzen van virtuele celmodellering te verleggen, dankbaar.

@nvidia biedt de AI-rekenkracht waarmee onderzoekers cellulair gedrag op ongekende schaal en complexiteit kunnen modelleren.

@10xGenomics is een life science-technologiebedrijf dat producten bouwt om de beheersing van de biologie te versnellen en de menselijke gezondheid te bevorderen.

@UltimaGenomics is een toonaangevende ontwikkelaar van goedkope, hoogwaardige sequencingtechnologie die continu de schaal van omics-informatie stimuleert om ongekende vooruitgang in de biologie en verbeteringen in de menselijke gezondheid mogelijk te maken.

Arc is van plan om de Virtual Cell Challenge elk jaar te herhalen met nieuwe single-cell datasets bestaande uit verschillende celtypen, en met zwaardere uitdagingen waarbij de modellen van deelnemers nodig zijn om de effecten van meer gecompliceerde veranderingen te voorspellen. Meld je aan voor updates op: